我国已构建起以国家农作物种质资源长期库及其复份库为重点，15个中期库、56个种质圃和214个原生境保护区为依托，省级资源库（圃）为补充的农作物种质资源保护体系。目前，国家农作物种质资源长期库保存能力已达到150万份。

其中，中国西南野生生物种质资源库是我国唯一的国家级野生生物种质资源库，也是世界上两个按国际标准建立的野生生物种质资源保藏设施之一。截至2024年底，该库已保存我国野生植物种子1.2万种10万份，合计保存各类野生生物种质资源超2.9万种33万份

近年来，各省市也加快了种质资源库建设步伐。2024年，四川省种质资源中心库全面建成并正式投入运行，可保存涵盖植物、畜禽、水产等遗传资源183.4万份，入选“国家西南特色种质资源中期库”

。同年12月，福建省农业生物种质资源库在福州揭牌，可保存各类农业生物种质资源50万份以上。